一般建议牙杯4-5个月换一次比较好。每天还要定时去清洁牙杯，并且消毒，不能仅随手冲一下，因为这样牙杯中容易滋生细菌。
生活中，牙杯和牙刷通常放在卫生间等比较密闭潮湿的环境中，如果使用时间比较长且不清洗，牙杯中可滋生的细菌数量会十分庞大，并且即便洗干净后，杯子在没完全晾干的状态下，也会滋生大量的细菌和霉菌，所以牙杯和牙刷应当定时清洗、更换。在每次刷完牙之后，尽量将牙杯以及牙刷也做到一同冲洗，并在晾干之后，再将牙刷、牙膏放进牙杯，这样在一定程度上避免潮湿的环境，也同时减少细菌繁殖的概率。
此外，牙杯还应当至少一个星期进行一次大清洁，可以定期煮沸消毒，煮沸的时间达到十分钟，或者在牙杯中倒入一些醋，浸泡一定时间，然后仔细地刷洗杯底，确保牙杯的底部清洁。不同的人在使用牙杯时，频率可能不一致，如果使用的频率较高，则要注意4个月更换一次较好，如果不频繁使用，可以适当延长使用时间，5个月后再更换。